Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
GPN3Q9UHW5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms