Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms