Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SPASTQ9UBP0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms