Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMT1Q9NXH9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMT1Q9NXH9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms