Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MCOLN1Q9GZU1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MCOLN1Q9GZU1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms