Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
POLR2J2Q9GZM3 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
POLR2J2Q9GZM3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms