Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR8

KRTAP3-1, Keratin-associated protein 3-1, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-1Q9BYR8 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 KATNBL1P2-201ENST00000433311 835 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 GOSR1-204ENST00000451249 1231 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
KRTAP3-1Q9BYR8 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms