Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RTFDC1Q9BY42 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RTFDC1Q9BY42 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms