Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC4A5Q9BY07 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms