Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF559Q9BR84 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ZNF559Q9BR84 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms