Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms