Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SORT1Q99523 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SORT1Q99523 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms