Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EYA3Q99504 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EYA3Q99504 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms