Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PSMD1Q99460 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms