Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RPS6KC1Q96S38 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RPS6KC1Q96S38 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms