Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PCNX1Q96RV3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCNX1Q96RV3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms