Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRERF1Q96PN7 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRERF1Q96PN7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms