Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CNBD2Q96M20 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CNBD2Q96M20 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms