Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM71F1Q96KD3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM71F1Q96KD3 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms