Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIRT1Q96EB6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIRT1Q96EB6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms