Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C17orf47Q8NEP4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms