Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIK3C3Q8NEB9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms