Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME9Q86XW9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms