Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SKAP1Q86WV1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SKAP1Q86WV1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms