Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATG4DQ86TL0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATG4DQ86TL0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms