Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMC4Q7Z404 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms