Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N1

COPS6, COP9 signalosome complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS6Q7L5N1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COPS6Q7L5N1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COPS6Q7L5N1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms