Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
BEND4Q6ZU67 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
BEND4Q6ZU67 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms