Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LRIG3Q6UXM1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms