Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Q6Q795 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Q6Q795 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Q6Q795 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Q6Q795 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms