Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC174Q6PII3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms