Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EFCAB12Q6NXP0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms