Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RHBDD2Q6NTF9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms