Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USPL1Q5W0Q7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USPL1Q5W0Q7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms