Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HDGFL1Q5TGJ6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms