Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPANXN3Q5MJ09 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms