Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AMER1Q5JTC6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AMER1Q5JTC6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms