Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PITRM1Q5JRX3 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PITRM1Q5JRX3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms