Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3KQ59H18 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TNNI3KQ59H18 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms