Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF7

HSP90AB3P, Putative heat shock protein HSP 90-beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB3PQ58FF7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HSP90AB3PQ58FF7 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSP90AB3PQ58FF7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms