Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
ANKRD39Q53RE8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms