Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RFTN2Q52LD8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RFTN2Q52LD8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms