Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP2B3Q16720 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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