Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HIST3H3Q16695 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms