Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PDK4Q16654 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PDK4Q16654 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PDK4Q16654 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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PDK4Q16654 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PDK4Q16654 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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PDK4Q16654 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PDK4Q16654 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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