Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SSX1Q16384 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SSX1Q16384 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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SSX1Q16384 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSX1Q16384 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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