Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCN9AQ15858 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN9AQ15858 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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