Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC85BQ15834 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CCDC85BQ15834 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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