Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NKX1-1Q15270 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NKX1-1Q15270 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
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