Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SPIDRQ14159 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SPIDRQ14159 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPIDRQ14159 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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